Il complesso monumentale della Rocca Strozzi appare oggi costituito da una fusione di diversi edifici distinti: il corpo di fabbrica della Rocca con le fortificazioni militari, i locali che attestano la successiva trasformazione in villa- fattoria che si snodano intorno ad un cortile interno, a un giardino e a vari annessi in cui la struttura rurale convive all’interno di un’architettura militare e le antiche fortificazioni si ingentiliscono nelle forme di villa suburbana
La Rocca Strozzi, al momento dell'acquisizione da parte del Comune, presentava evidenti segni di degrado dovuti al progressivo e lento abbandono del complesso; il fluire del tempo stava cancellando gradualmente i segni dell'originaria funzione difensiva della fortezza e della successiva trasformazione in villa-fattoria.
L'allestimento del Museo ha interessato i locali al piano terra della villa-fattoria e i locali della ex tinaia, seguendo una precisa progettazione di percorsi condivisi con la Soprintendenza competente.